Uji In Silico Senyawa Phytol Hasil Ekstrak Daun Zodia (Evodia sauveolens) sebagai Antikanker

In Silico Studies of Compound Phytol from Zodia Leaf Extract (Evodia suaveolens) as Anticancer

Kanker merupakan penyakit mematikan ditandai dengan ploriferasi sel atau pembelahan sel yang tidak terkontrol. Pengobatan kanker dengan pembedahan dan radioterapi paling efektif untuk kanker lokal dan non-metastasis. Selain pengobatan secara medis, pasien penderita kanker juga menggunakan pengobatan herbal karena lebih rendahnya efek samping yang diberikan. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui aktivitas senyawa phytol hasil ekstrak daun Zodia (Evodia sauveolens) sebagai antikanker secara in silico. Teknik penelitian ini secara in silico dimana menggunakan aplikasi komputer yang melakukan kajian interaksi sekaligus memprediksi aktivitas senyawa hipotetik. Beberapa langkah yang dilakukan yaitu tahap preparasi sampel (koleksi ligan senyawa, koleksi protein, sterilisasi dan minimasi), tahapan molecular docking lalu tahapan visualisasi. Tanaman Zodia terbukti memiliki aktivitas antikanker baik secara in vitro maupun in vivo dengan mengurangi aktivitas hambat pada proses proliferasi, metastasis, dan invasi, dan juga merangsang proses apoptosis berbagai jenis sel tumor. Pada penelitian ini menggunakan senyawa Phytol yang merupakan salah satu dari sekian banyak senyawa yang terkandung di dalam ekstrak daun Zodia, dan memiliki potensi sebagai antikanker kolorektal secara in silico. Hasil penelitian ini yaitu molecular docking antara senyawa phytol dengan protein ALK berupa data nilai binding affinity sebesar -5,8 kcal/mol dan nilai RMSD 1,448 Å. Senyawa phytol tidak efektif untuk dijadikan calon obat antikanker kolorektal, dilihat dari bioaktivitas senyawa phytol yang terlihat adanya aktivitas antiinflamasi dari adanya penghambatan migrasi neutrophil, dan mengurangi inflamasi interleukin (IL-1β) dan Tumor Necrosis Factor (TNF-α) dan stres oksidatif.

Kata kunci: Kanker, Phytol, Zodia, In Silico

Cancer is a deadly disease characterized by uncontrolled cell plorifation or cell division. Treatmentof cancer with surgery and radiotherapy is most effective for local and non-metastatic cancers. In addition to medical treatment, cancer patients also use herbal treatments because of the lower side effects given. The purpose of this study is to find out the activity of phytol compounds resulting from Zodia leaf extract (Evodia sauveolens) as an anticancer in silico. This research technique is in silico where using computer application that conducts interaction studies while predicting the activity of hypothetical compounds. Some of the steps performed are the sample preparation stage (collection ligan compound, protein collection, sterilization and minimization), molecular docking stage and visualization stage. Zodia plants are proven to have anticancer activity both in vitro and in vivo by reducing the activity of slaves in the process of proliferation, metastasis, and invasion, and also stimulate the apoptosis process of various types of tumor cells. In this study using Phytol compound which is one of the many compounds contained in Zodia leaf extract, and has the potential as a colorectal anticancer in silico. The result of this study is molecular docking  between phytol compounds and ALK proteins in the form of binding  affinity value data of  -5.8  kcal / mol and RMSD  value of 1,448  Å. Phytol compounds are not effective to be candidates for colorectal anticancer drugs, judging by the bioactivity of phytol compounds that are seen the presence of anti-inflammatory activity of adanya  inhibition of neutrophil migration,and  reduce inflammation of interleukin (IL-1β)  and  Tumor  Necrosis  Factor  (TNF-α) and oxidative stress.

Keywords: Cancer, Phytol, Zodia, In Silico