Isolasi, Karakterisasi, dan Identifikasi Bakteri Patogen pada Tumbuhan Kantong Semar (Nepenthes gracillis)

Isolation, Characterization, and Identification of Pathogenic Bacteria in Kantong Semar Plants (Nepenthes gracillis)

Nepenthes merupakan tumbuhan karnivora dilindungi dan unik karena memiliki kantong berisi cairan pada ujung daun yang berfungsi sebagai perangkap serangga. Keberadaan Nepenthes gracillis dalam ekosistem terancam punah, yang salah satunya disebabkan serangan bakteri patogen, maka perlu adanya identifikasi bakteri patogen yang menyerang N. gracillis sebagai upaya penanganan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi, mengkarakterisasi, dan mengidentifikasi bakteri patogen pada N. gracillis menggunakan metode karakterisasi morfologi, uji hipersensitif, uji patogenisitas dan analisis BLAST hasil sekuensing gen 16S rRNA pada GenBank NCBI. Hasil uji hipersensitif dan uji patogenisitas menunjukkan isolat bakteri A1 merupakan bakteri patogen tanaman yang menyerang N. gracillis dengan karakteristik morfologi yang sama dengan bakteri genus Erwinia, yaitu bakteri gram negatif, diplococcus, bentuk koloni bulat, tepi koloni rata, warna koloni putih krem, permukaan koloni cembung, dan sekuensing gen 16S rRNA menunjukkan isolat bakteri A1 yang berhasil diisolasi memiliki panjang DNA 900 bp, analisis BLAST pada GenBank NCBI isolat bakteri A1 memiliki similaritas 97,33% dengan bakteri patogen Erwinia aphidicola. Dan disimpulkan bahwa isolat bakteri A1 yang menyebabkan penyakit bintil dan bercak merah pada daun N. gracillis merupakan bakteri patogen tanaman dari genus Erwinia.

Kata kunci: bakteri patogen, identifikasi, Nepenthes gracillis, sekuen gen 16S rRNA

Nepenthes is a protected and unique carnivorous plant because it has a fluid-filled pouch at the end of the leaf that serves as an insect trap. The existence of Nepenthes gracillis in ecosystems is endangered, one of the reason is caused by the attack of pathogenic bacteria, so it is necessary to identify pathogenic bacteria that attack N. gracillis as an effort to handle. The purpose of this study was to isolate, characterized, and identify pathogenic bacteria in N. gracillis using morphological characterization methods, hypersensitivity tests, pathogenicity tests and BLAST analysis of 16S rRNA gene sequencing results on NCBI GenBank. Hypersensitivity test results and pathogenicity test showed that isolate of bacteria A1 is a plant pathogenic bacteria that attacks N. gracillis with morphological characteristics same as the bacterium genus Erwinia, gram-negative bacteria, diplococcus, round colony shape, flat colony edge, creamy white colony color, convex colony surface, and gene sequencing 16S rRNA showed that the isolate of A1 bacteria that were successfully isolated had a DNA length of 900 bp, BLAST analysis on GenBank NCBI bacterial isolate A1 had a similarity of 97.33% with the pathogenic bacteria Erwinia aphidicola. So it can be concluded that the isolate of bacteria A1 that causes bintil disease and red patches on the leaves of N. gracillis is a plant pathogenic bacteria of the genus Erwinia.

Keywords: pathogenic bacteria, identification, Nepenthes gracillis, 16S rRNA gene sequencing