Isolasi Senyawa Dari Daun Lamtoro Mini (Desmanthus virgatus) Sebagai Antibakteri Staphylococcus aureus dan Escherichia coli Secara In Silico dan In Vitro

Isolation of Compounds from Mini Lamtoro (Desmanthus virgatus) Leaves as Antibacterials of Staphylococcus aureus and Escherichia coli In Silico and In Vitro

Abstrak

Daun lamtoro mini (Desmanthus virgatus) merupakan tanaman liar yang mengandung berbagai senyawa metabolit. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi senyawa dari ekstrak n-heksana daun lamtoro mini serta mengevaluasi aktivitas antibakterinya terhadap Staphylococcus aureus dan Escherichia coli. Hasil analisis karakterisasi senyawa menunjukkan bahwa senyawa yang diisolasi merupakan β-sitosterol. Study molecular docking β-sitosterol memiliki binding affinity terhadap DNA Gyrase S. aureus -11.69 kcal/mol dan E. coli -10.17 kcal/mol yang lebih negatif dibanding ciprofloxacin yaitu -9,10 kkal/mol terhadap S. aureus dan -5,93 kkal/mol terhadap E. coli sehingga menghasilkan afinitas ikatan yang lebih kuat. Penghambatan β-sitosterol pada PBP S. aureus dan E. coli mempunyai nilai binding affinity sebesar -6,33 kkal/mol dan -10.32 kkal/mol.  Hasil analisis in vitro menunjukkan β-sitosterol mampu menghambat pertumbuhan S. aureus sebesar 17.69 mm dan terhadap E. coli sebesar 18.51 mm pada masing-masing konsentrasi 500 ppm. Hasil ini mengindikasikan bahwa β-sitosterol mempunyai potensi sebagai agen antibakteri terhadap kedua bakteri uji.

Kata kunci: Lamtoro mini, isolasi, β-sitosterol, molecular docking, zona hambat

Abstract

Mini lamtoro leaves (Desmanthus virgatus) are wild plants that contain various metabolic compounds. This study aims to isolate compounds from n-hexane extracts of mini lamtoro leaves and evaluate their antibacterial activity against Staphylococcus aureus and Escherichia coli. The results of compound characterization analysis show that the isolated compound is β-sitosterol. Molecular docking studies of β-sitosterol showed binding affinities toward DNA gyrase of S. aureus (-11.69 kcal/mol) and E. coli (-10.17 kcal/mol), which were more negative than those of ciprofloxacin (-9.10 kcal/mol for S. aureus and -5.93 kcal/mol for E. coli), resulting in stronger binding affinities. The inhibition of β-sitosterol on PBP in S. aureus and E. coli has a binding affinity value of -6.33 kcal/mol and -10.32 kcal/mol, respectively.  In vitro analysis results show that β-sitosterol can inhibit the growth of S. aureus by 17.69 mm and E. coli by 18.51 mm at a concentration of 500 ppm. These results indicate that β-sitosterol has potential as an antibacterial agent against both test bacteria.

Keyword: Mini lamtoro, isolation, β-sitosterol, molecular docking, inhibition zone