Studi Pengembangan Obat Kanker Kolon dari Turunan Asam Elagat
Colon Cancer Drug Development Study of Ellagic Acid Derivatives
Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan obat kanker kolon dengan bahan baku senyawa Asam Elagat dan turunanya menggunakan metode Hubungan Kuantitatif Struktur-aktivasi (HKSA) dan penambatan molekular. Deskriptor yang dipakai HKSA meliputi deskriptor elektronik, sterik, dan hidrofobik. Karakter dari masing-masing descriptor dikomputasikan menggunakan software NWchem dan MarvinSketch dengan teori HF (Hartree-Fock). Penambatan molekul dilakukan dengan menggunakan software Autodock Tools dan Biovia. Hasilnya menunjukkan bahwa model persamaan terbaik HKSA senyawa bahan obat dari asam elagat dan turunanya adalah Log P = -7.103 + (-0.005*PSA) + (-0.729*MR) + (0.003*Volume) + (0.002*SA) + (-99.912*Homo) + (-38.893*Lumo)+ (-0.072*MD)+ (0.006*Eh) + (1.409*P) yang diperoleh untuk senyawa 2,3,7-trichloro-8-methoxychromeno[5,4,3-cde]chromene-5,10-dione. Hasil penambatan molekular tersebut memiliki energi ikat sebesar -9.94 kcal/mol dan konstanta inhibisi 51.54 nM (nanomolar).
This study aims to develop a colon cancer drug with a raw material of Ellagic Acid and its derivatives using the Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) method and molecular docking. The descriptors used in QSAR were electronic, steric, and hydrophobic descriptors. The characters of each descriptor were computed using NWchem and MarvinSketch software with the HF (Hartree-Fock ) theory. Molecular docking was performed using Autodock Tools and Biovia software. The results show that the best equation QSAR model for medicinal compounds from ellagic acid and derivatives is Log P = -7.103 + (-0.005 * PSA) + (-0.729 * MR) + (0.003 * Volume) + (0.002 * SA) + (- 99,912 * Homo) + (-38,893 * Lumo) + (-0.072 * MD) + (0.006 * Eh) + (1.409 * P) obtained for 2,3,7-trichloro-8-methoxychromeno [5,4, 3-cde] chromene-5,10-dione compound. The result of molecular docking has a binding energy of -9.94 kcal/mol and an inhibition constant of 51.54 nM (nanomolar).